如何讓W(xué)B的結(jié)果更完美?
在Western Blot(WB)的實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,總會(huì)遇到各種各樣的問(wèn)題:沒(méi)有條帶,雜帶多,轉(zhuǎn)膜不成功,曝光時(shí)間把握不好……不要著急,根據(jù)多年的WB經(jīng)驗(yàn),我們總結(jié)了以下WB實(shí)驗(yàn)過(guò)程中出現(xiàn)各種突發(fā)狀況的分析和處理方法:
1. SDS-PAGE出現(xiàn)異常條帶
1)微笑現(xiàn)象
處理方法:可能是由于凝膠的中間部分凝固不均導(dǎo)致,待其充分凝固后再做實(shí)驗(yàn)。
2)拖尾現(xiàn)象
處理方法:可能是由于樣品融解效果不佳或分離膠濃度過(guò)大引起。建議:加樣前離心;加適量樣品促溶劑;電泳緩沖液時(shí)間過(guò)長(zhǎng),重新配制;降低凝膠濃度。
3)條帶粗
處理方法:可能是由于濃縮膠未濃縮好。建議:增加濃縮膠長(zhǎng)度;保證濃縮膠的pH正確(6.7);降低電壓。
4)紋理現(xiàn)象
處理方法:可能是由于樣本中不溶性顆粒引起的。建議:加樣前離心;加適量樣品促溶劑。
2. 轉(zhuǎn)膜條件及膜的選擇
下圖為不同轉(zhuǎn)膜方法的轉(zhuǎn)膜效率:
可以觀察到轉(zhuǎn)膜效率:濕轉(zhuǎn)過(guò)夜>濕轉(zhuǎn)3小時(shí)>半干轉(zhuǎn)1小時(shí)。
在轉(zhuǎn)膜過(guò)程中,靶蛋白分子量小轉(zhuǎn)印時(shí)間縮短,分子量大則適當(dāng)延長(zhǎng)轉(zhuǎn)膜時(shí)間。并建議優(yōu)先選擇聚偏二氟乙烯膜(PVDF)膜,相對(duì)硝酸纖維素(NC)膜機(jī)械強(qiáng)度高,和蛋白結(jié)合牢。
3. 條帶出現(xiàn)降解或斷裂帶
lane 13:心臟組織震動(dòng)溶解2h;lane 14:心臟組織短時(shí)超聲;lane 15:心臟組織超聲10min
處理方法:樣本制備過(guò)程中盡量保持低溫,避免蛋白變性、降解、斷裂,對(duì)于胃腸胰等蛋白酶含量高的樣本建議添加蛋白酶抑制劑,蛋白酶抑制劑建議新鮮配制。
4. 曝光時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或過(guò)短出現(xiàn)非特異性帶或條帶消失
處理方法:建議選不同時(shí)間點(diǎn)多曝光幾次。
5. 條帶不整齊
處理方法:可能是由于膠凝固不均勻,建議待膠完全凝固后上樣;可能是由于電泳的時(shí)候,有氣泡在膠的下邊緣,建議電泳前,檢查并趕走膠底部的氣泡;可能是由于上樣buffer不是工作液濃度,建議重新配置上樣buffer;可能是由于拔梳子導(dǎo)致樣品孔不齊,建議水平緩慢的拔梳子。
6. 無(wú)條帶
處理方法:可能是轉(zhuǎn)膜失敗,可以通過(guò)立春紅染色檢驗(yàn);可能是一抗二抗用錯(cuò)或濃度不合適,可設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照或重新調(diào)整抗體濃度;ECL發(fā)光底物失效,可換用新的發(fā)光底物。
WB的實(shí)驗(yàn)流程相對(duì)較長(zhǎng),每個(gè)步驟都會(huì)對(duì)最后的實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成影響。我們?cè)趯?shí)驗(yàn)過(guò)程中,應(yīng)做好實(shí)驗(yàn)對(duì)照、實(shí)驗(yàn)記錄,步步監(jiān)測(cè),方便查找原因。