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一個(gè)與多種疾病有關(guān)的超家族:溶質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族

溶質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(SLCs)超家族目前包括65個(gè)家族,439個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(不包括假基因),是人類(lèi)基因組的第二大膜蛋白家族。它參與了細(xì)胞間的多種物質(zhì)運(yùn)輸,包括糖、氨基酸、維生素、核苷酸、金屬、無(wú)機(jī)離子、有機(jī)陰離子、寡肽和藥物。由于SLCs是多種物質(zhì)進(jìn)入或離開(kāi)細(xì)胞的主要調(diào)節(jié)因子之一,因此它的運(yùn)輸功能與多種疾病和機(jī)體免疫應(yīng)答有關(guān),如慢性疾病、精神障礙、心血管疾病和癌癥。目前,對(duì)溶質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的研究已經(jīng)深入到人類(lèi)疾病的各個(gè)領(lǐng)域,本文對(duì)部分SLCs與疾病的關(guān)系進(jìn)行簡(jiǎn)述。

 

圖1. SLC30A8蛋白結(jié)構(gòu)

(圖片來(lái)源于https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q8IWU4)

1. SLCs結(jié)構(gòu)和運(yùn)輸機(jī)制

SLC的命名是根符號(hào)SLC加數(shù)字、字母和數(shù)字,如SLC3A1。SLCs轉(zhuǎn)運(yùn)體與至少一個(gè)其他成員含有20%-50%同源性。迄今為止,已知結(jié)構(gòu)的SLCs預(yù)計(jì)包含1-16個(gè)跨膜(TM)結(jié)構(gòu)域,明顯的特征是跨核心TM域的偽對(duì)稱性。SLC中最常見(jiàn)的兩個(gè)結(jié)構(gòu)折疊是major facilitator superfamily(MFS)和leucine transporter(LeuT)樣折疊。

蛋白質(zhì)的物理結(jié)構(gòu)決定了其交替通路轉(zhuǎn)運(yùn)的具體機(jī)制。膜輸送可分為被動(dòng)和主動(dòng)兩種,被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)可分為擴(kuò)散和促進(jìn)擴(kuò)散,主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)包括初級(jí)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)和二級(jí)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)。SLCs的功能是促進(jìn)擴(kuò)散和二次主動(dòng)運(yùn)輸。二級(jí)活性轉(zhuǎn)運(yùn)體利用預(yù)先存在的離子梯度作為能量來(lái)源,以相同或相反的方向運(yùn)輸?shù)孜锖土硪粋€(gè)或多個(gè)溶質(zhì)(最典型的是離子)。例如,SLC1A2主要定位于星形膠質(zhì)細(xì)胞,負(fù)責(zé)90%以上的谷氨酸攝取,共轉(zhuǎn)運(yùn)Na+和H+,反轉(zhuǎn)運(yùn)K+,實(shí)現(xiàn)谷氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)。同向轉(zhuǎn)運(yùn)體和反向轉(zhuǎn)運(yùn)體是兩種二級(jí)活性轉(zhuǎn)運(yùn)體,它們利用下坡離子梯度作為與底物運(yùn)輸方向相同(同向轉(zhuǎn)運(yùn)體)或相反(反向轉(zhuǎn)運(yùn)體)的驅(qū)動(dòng)力。這些轉(zhuǎn)運(yùn)體的底物特異性不僅取決于氨基酸殘基和底物之間的相互作用,還取決于調(diào)節(jié)門(mén)控和/或選擇性元件的分子內(nèi)相互作用。

 

2. SLCs與疾病的關(guān)系

一些SLCs被發(fā)現(xiàn)具有組織特異性,對(duì)某些細(xì)胞類(lèi)型發(fā)揮獨(dú)特的作用,最典型的例子是SLC6和SLC18家族的特定轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,它們調(diào)節(jié)突觸中的神經(jīng)遞質(zhì)濃度。許多不同的SLCs家族也參與通過(guò)組織之間的選擇性屏障(如血腦屏障或腸道上皮)運(yùn)輸營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),為它們提供必要的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。一些SLCs現(xiàn)在也被理解為受體,既作為細(xì)胞的轉(zhuǎn)運(yùn)體又作為細(xì)胞的受體,使得轉(zhuǎn)運(yùn)也作為細(xì)胞內(nèi)的信號(hào)系統(tǒng)。因此,有人認(rèn)為SLCs參與遙感和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),這一假設(shè)表明SLCs和其他轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白通過(guò)其表達(dá)或活性的改變來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞甚至組織功能。根據(jù)這一假設(shè),轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白可參與器官間的信號(hào)傳遞。例如,與糖尿病密切相關(guān)的鋅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白SLC30A8在胰腺細(xì)胞膜上高表達(dá),轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白將鋅從細(xì)胞質(zhì)輸入到胰島素分泌顆粒中。隨后,胰島素和鋅的共同分泌不僅會(huì)影響鄰近的內(nèi)分泌細(xì)胞,而且鋅還會(huì)作為信號(hào)分子,抑制下游肝臟胰島素清除,從而使胰島素進(jìn)入全身。

SLC3和SLC7,在功能上密切相關(guān),這些家族的蛋白質(zhì)可以通過(guò)二硫橋連接,形成一種被稱為異聚氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(HATs)的蛋白質(zhì)復(fù)合物,這些SLC3/SLC7二聚體促進(jìn)了多種物質(zhì)的運(yùn)輸。這些二聚體對(duì)于維持細(xì)胞的氧化還原平衡至關(guān)重要,在癌細(xì)胞中的表達(dá)增加可以使細(xì)胞減少氧化應(yīng)激,避免細(xì)胞凋亡。

SCL26家族在胃腸道中尤為重要,在胃腸道中它們調(diào)節(jié)pH值,具有吸水性和特定底物的吸收或分泌。比如SLC26A1和SLC26A2是腸道中SO42-攝取的最大來(lái)源,分別定位于細(xì)胞的基底外側(cè)膜和頂端膜。SLC26A3是一種Cl-/HCO3-轉(zhuǎn)運(yùn)體,對(duì)黏液膜和上皮組織的形成至關(guān)重要,有研究發(fā)現(xiàn)其表達(dá)在腺瘤中經(jīng)常下調(diào)。

SLC30家族的功能是降低細(xì)胞內(nèi)鋅的水平,而SLC39蛋白的功能是增加鋅的濃度。SLC39A4主要在腸道表達(dá),其表達(dá)和定位受到轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后兩種方式的嚴(yán)格調(diào)控。SLC39A4也被證明在更具侵襲性的卵巢癌和胰腺癌中過(guò)表達(dá),可能是對(duì)癌癥組織中鋅水平降低的反應(yīng)。

 

圖2. 鋅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在不同時(shí)期B細(xì)胞中的作用

(圖片來(lái)源于《Acta Pharmaceutica Sinica B》雜志)

SLC8家族在細(xì)胞信號(hào)和內(nèi)穩(wěn)態(tài)中具有關(guān)鍵作用,它與不同的疾病有牽連,如癌的侵襲增加、糖尿病和異常的心臟信號(hào)。SLC24利用Na+和K+的電化學(xué)梯度來(lái)驅(qū)動(dòng)Ca2+的流出,這些蛋白質(zhì)在許多不同的組織類(lèi)型中表達(dá),在光感受器、神經(jīng)元和平滑肌細(xì)胞中較多。SLC24A4以及SLC8A3,已經(jīng)被證明在治療耐藥的卵巢癌細(xì)胞中過(guò)表達(dá)。

SLC22家族及其轉(zhuǎn)運(yùn)底物在癌癥的發(fā)生發(fā)展中具有廣泛的作用。該家族成員在胰腺癌和肝癌患者組織中均有下調(diào)(SLC22A1, SLC22A2, SLC22A11)和上調(diào)(SLC22A3和SLC22A18),不同的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對(duì)蛋白的長(zhǎng)期生存有不同的影響。SLC22A6轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的表達(dá)受到癌癥治療方案的影響,甲氨蝶呤會(huì)下調(diào)該蛋白。同樣,用于治療慢性髓系白血病的藥物伊馬替尼也能改變SLC22A1的表達(dá)。SLC14家族只包含2個(gè)不同的基因,SLC14A1和SLC14A2,這兩個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的主要功能是在腎臟中濃縮尿素,使尿素排泄,并通過(guò)尿素在細(xì)胞膜上的被動(dòng)運(yùn)動(dòng)重新吸收水分。

 

3. SLCs的表達(dá)

盡管所有的膜蛋白加在一起約占整個(gè)蛋白質(zhì)組的三分之一和目前所有治療靶點(diǎn)的三分之二,但已闡明的膜蛋白結(jié)構(gòu)的數(shù)量非常少,迄今為止在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)中保存了約280種獨(dú)特的結(jié)構(gòu)(可從www.rcsb.org/獲得),占所有可用3d分辨率結(jié)構(gòu)的不到1%。嵌入在磷脂雙分子層中的整體膜蛋白的疏水片段,使膜蛋白難以表達(dá)和結(jié)晶。由于這個(gè)問(wèn)題,膜蛋白的結(jié)構(gòu)確定一直被認(rèn)為是一個(gè)非常困難的任務(wù)。

云克隆開(kāi)發(fā)了上述研究中涉及的相關(guān)指標(biāo)的蛋白、抗體、ELISA試劑盒等產(chǎn)品以助力腫瘤治療相關(guān)研究,部分指標(biāo)的抗體檢測(cè)結(jié)果如下:

 

圖3. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 3, Member 2(SLC3A2)

 

圖4. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 30 Member 8(SLC30A8)

 

圖5. Polyclonal Antibody to Solute Carrier Family 30, Member 3 (SLC30A3)

云克隆SLCs超家族相關(guān)指標(biāo):

指標(biāo)名

核心貨號(hào)

指標(biāo)名

核心貨號(hào)

OSTb

C697

SLC26A4

E474

OSTa

F705

SLC26A6

E476

OSCP1

G601

SLC26A7

E477

SLC1A5

E345

SLC30A1

E487

SLC3A2

E348

SLC30A3

G575

SLC6A11

P673

SLC30A4

E488

SLC7A11

E410

SLC30A5

G576

SLC7A9

E419

SLC30A6

G577

SLC10A3

E423

SLC30A7

E489

SLC10A7

E424

SLC30A8

E490

SLC16A1

E431

SLC30A10

N188

SLC16A2

E432

SLC34A1

E495

SLC16A3

E433

SLC34A2

G571

SLC16A4

E434

SLC35B4

E499

SLC16A8

G592

SLC39A4

E484

SLC22A9

E449

SLC39A6

E486

SLC22A11

E450

SLC39A7

E485

SLC22A18

E452

SLCO1A2

E516

SLC24A5

E440

SLCO3A1

E520

SLC25A13

E463

SLCO4A1

E521

SLC25A39

E457

SLCO1B2

S904

 

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參考文獻(xiàn):

1. Pizzagalli MD, Bensimon A, Superti-Furga G. A guide to plasma membrane solute carrier proteins. FEBS J. 2021 May;288(9):2784-2835. doi: 10.1111/febs.15531. Epub 2020 Sep 18. PMID: 32810346; PMCID: PMC8246967.

2. Hu C, Tao L, Cao X, Chen L. The solute carrier transporters and the brain: Physiological and pharmacological implications. Asian J Pharm Sci. 2020 Mar;15(2):131-144. doi: 10.1016/j.ajps.2019.09.002. Epub 2019 Nov 13. PMID: 32373195; PMCID: PMC7193445.